Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms