Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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