Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ptchd1Q14B62 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms