Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem52bQ0VBF2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms