Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms