Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms