Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cib3Q0P523 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms