Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms