Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms