Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms