Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms