Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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