Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms