Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms