Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms