Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms