Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms