Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rbp4Q00724 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms