Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms