Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms