Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl21cP86793 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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