Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms