Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms