Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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