Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp46P62069 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp46P62069 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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