Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms