Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms