Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgd1P52734 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms