Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GdnfP48540 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms