Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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VdrP48281 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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VdrP48281 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VdrP48281 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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