Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms