Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms