Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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