Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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