Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms