Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ly6dP35459 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ly6dP35459 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ly6dP35459 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms