Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sftpa1P35242 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sftpa1P35242 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sftpa1P35242 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sftpa1P35242 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sftpa1P35242 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms