Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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