Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rom1P32958 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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