Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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