Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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