Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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