Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms