Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZfaP23607 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms