Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5bP21271 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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