Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms