Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TP20293 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TP20293 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TP20293 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TP20293 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TP20293 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TP20293 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TP20293 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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