Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms