Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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