Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms